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隨著“生命科學(xué)阿波羅計劃”――人類基因組計劃的提前完成,，蛋白質(zhì)研究進(jìn)入到一個高潮迭起的新時代。后基因組時代的生命科學(xué)重心,，已從解析生命的遺傳密碼轉(zhuǎn)移到系統(tǒng)研究這些遺傳密碼代表的生物學(xué)功能上來,。 盡管在信使核糖核酸（mRNA）的水平上也能一定程度地研究基因表達(dá)，如基因表達(dá)連續(xù)分析法（ serial analysis of gene expression,，SAGE ）和微陣列芯片（ microarray chip）研究,。但是,，近年來越來越多的證據(jù)表明，基因表達(dá)中間產(chǎn)物mRNA 水平的研究并不能取代蛋白質(zhì)水平的研究,。因為,，mRNA與表達(dá)蛋白質(zhì)的相關(guān)性不高，并且體內(nèi)蛋白質(zhì)還存在多種多樣的,、與其功能密切相關(guān)的翻譯后加工修飾,。因此，要精確地研究基因的功能,，還是要回到執(zhí)行生命功能的蛋白質(zhì)本身上來,。 與此前的蛋白質(zhì)研究技術(shù)不同，后基因組時代的蛋白質(zhì)研究是從整體水平上解析基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)功能,，這就需要有和基因組大規(guī)模測序技術(shù)類似的高通量研究手段,。90 年代中期，包括人類在內(nèi)的多種生物基因組計劃的完成累積了大量基因序列數(shù)據(jù),，并且這時候新出現(xiàn)的生物質(zhì)譜技術(shù)已能對蛋白質(zhì)進(jìn)行高效靈敏地分析和測序,，再加上計算機數(shù)據(jù)處理能力的大幅提高和互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)的逐漸應(yīng)用，使得科學(xué)家一直期待的這種研究開始成為現(xiàn)實可能,。
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